荧光显微光学切片断层成像系统(fMOST)
-
0/人使用者
-
0/次机时次数
-
0/小时总时长
-
0/次送样次数
-
0/人收藏者
-
收费标准
机时0元/小时 -
设备型号
BioMapping5500 -
当前状态
-
管理员
曲正阳,孙小月 13121050588 18132468722 -
放置地点
中国中医科学院针灸研究所509实验室
- 仪器信息
- 预约资源
- 检测项目
- 附件下载
- 公告
- 同类仪器
名称
荧光显微光学切片断层成像系统(fMOST)
资产编号
荧光显微光学切片断层成像系统(fMOST)
型号
BioMapping5500
规格
1.6m*0.9m*2m
产地
中国
厂家
武汉沃亿生物有限公司
所属品牌
武汉沃亿生物有限公司
出产日期
购买日期
所属单位
经络研究中心
使用性质
科研
所属分类
细胞/形态学测定分析平台
资产负责人
孙小月 曲正阳
联系电话
13121050588,18132468722
联系邮箱
放置地点
中国中医科学院针灸研究所509实验室
- 主要规格&技术指标
- 主要功能及特色
- 样本检测注意事项
- 设备使用相关说明
主要规格&技术指标
1. 光源性能
1)可激发GFP,PI,mCherry,DsRed Tdtomato等常用荧光标记物;
2)光源照明强度可通过软件进行实时控制,可连续稳定工作时间≥10000hr。
3)配置473,561nm激光器,均来源于长春光机所,使用寿命10000h
2成像性能
①成像模式至少包含荧光成像;
②探测通道数 2 channel;
③配套20× NA1.0高性能物镜;40× NA0.8高性能物镜;60× NA1.0高性能物镜
④在允许的任意大小样品的任意位置均可达到≤0.4µm的横向光学分辨能力;
⑤在允许的任意大小样品的任意位置均可达到≤2µm的轴向光学分辨能力;
3全自动连续切片性能
①全自动三维高精密运动模块:行程≥210mm@X,100mm@Y,70mm@Z;最小步进:≤0.001µm @X,Y0.1µm @Z;双向重复定位精度:±0.04µm @X,Y ±0.07μm@Z
②适用类型:树脂包埋样品,全自动连续切削厚度:≤1µm
③设备为高分辨荧光三维断层成像系统,将制备好的样品固定于样品台,设定好切片参数和程序再无需任何手工操作即完成全自动超薄切片、高分辨荧光三维成像、数据存储和处理分析。
4探测性能和扫描性能
①体素分辨率优于0.4µm×0.4µm×1µm;
②可见光波段量子效率≥40%;
③动态范围达到16bit;
④样本大小在三个方向均可大于2cm,总体可大于20cm³;
⑤对于0.5cm³体积样品:在采样点尺寸小于0.4µm×0.4µm×2µm时,三维全脑成像时间≤ 96hr;
5整体系统性能
①具备全自动的扫描成像能力,开启后无需人工干预;
②具备连续不停机工作≥700小时进行数据采集的能力;
③图像分辨率、信噪比等关键指标在全脑数据集的任意位置均能保持一致。
6存储性能
①可配置raid5或raid6;
②在配置为raid5时,可用存储容量≥70TB,并具有在未来扩展到160T的能力;
③顺序读速度≥1.5Gbps,顺序写速度≥0.8Gbps。
7控制主机最低配置
一线品牌工作站: CPU:金牌5122 3.8GHz或同级别;内存:DDR4 128G;显卡:NVIDIA T1000 4GB显卡或同级别;
①系统盘:256G SATA固态硬盘
②数据硬盘:1个8TB企业级
③操作系统:正版Windows 10专业版64位;
④输入输出设备:22英寸液晶显示器、无线键鼠;
8软件功能
①自动探测样品轮廓(实时获取有效数据范围,避免无效数据的采集);
②采集图像live显示(实时显示正在获取的图像);
③采集图像recall显示(可方便查看、浏览已采集的数据,提供可快速定位数据区域的导航功能);
④实时生成三维投影图(通过降维处理,便于快速预览部分实验结果);
⑤数据实时打包以及传输(可在数据采集的过程中,将数据实时传输到远程存储服务器,避免100MB以下小文件的低效率传输);
⑥硬件的软件控制(通过软件,实现对光源、运动控制、探测器等大部分设备的参数调节、开关机控制);
⑦联网远程监控接口(可将仪器运行状况传递给远程的中控台);
⑧异常自动报警(采集发生异常时,可通过以太网、电信网通知管理员);
⑨断点自动恢复(可中断数据采集,并在合适的时间进行自动恢复);
⑩日志功能(记录操作、异常等);
⑪远程海量存储支持(可通过samba等方式远程连接PB级海量存储,需提供可行的解决方案)。
9图像处理工作站
CPU:至强金5122,3.8GHz或同级别;内存:256GB 2400MHz DDR4;显卡:NVIDIA RTX A2000 12GB显卡或同级别或同级别;说明:高性能工作站可实现TB级图像数据的加载、分析处理及三维可视化。
系统盘:256GB SATA固态盘
数据盘:1T企业级×8
显示器:U2518DR或同级别
操作系统:Win10专业版64位
10图像处理软件功能
包含原始2D图像拼接、去躁、均一化等功能;
包含三维数据处理和分析相关软件等
上述参数可满足常规模式动物小鼠、大鼠等大组织器官高精度三维成像,最大成像尺寸5cm×5cm×2.5cm,40倍物镜下成像分辨率为0.35×0.35×1μm可成像出神经纤维结构的完整形态,可满足对中枢及外周大组织精细结构的三维成像。
1)可激发GFP,PI,mCherry,DsRed Tdtomato等常用荧光标记物;
2)光源照明强度可通过软件进行实时控制,可连续稳定工作时间≥10000hr。
3)配置473,561nm激光器,均来源于长春光机所,使用寿命10000h
2成像性能
①成像模式至少包含荧光成像;
②探测通道数 2 channel;
③配套20× NA1.0高性能物镜;40× NA0.8高性能物镜;60× NA1.0高性能物镜
④在允许的任意大小样品的任意位置均可达到≤0.4µm的横向光学分辨能力;
⑤在允许的任意大小样品的任意位置均可达到≤2µm的轴向光学分辨能力;
3全自动连续切片性能
①全自动三维高精密运动模块:行程≥210mm@X,100mm@Y,70mm@Z;最小步进:≤0.001µm @X,Y0.1µm @Z;双向重复定位精度:±0.04µm @X,Y ±0.07μm@Z
②适用类型:树脂包埋样品,全自动连续切削厚度:≤1µm
③设备为高分辨荧光三维断层成像系统,将制备好的样品固定于样品台,设定好切片参数和程序再无需任何手工操作即完成全自动超薄切片、高分辨荧光三维成像、数据存储和处理分析。
4探测性能和扫描性能
①体素分辨率优于0.4µm×0.4µm×1µm;
②可见光波段量子效率≥40%;
③动态范围达到16bit;
④样本大小在三个方向均可大于2cm,总体可大于20cm³;
⑤对于0.5cm³体积样品:在采样点尺寸小于0.4µm×0.4µm×2µm时,三维全脑成像时间≤ 96hr;
5整体系统性能
①具备全自动的扫描成像能力,开启后无需人工干预;
②具备连续不停机工作≥700小时进行数据采集的能力;
③图像分辨率、信噪比等关键指标在全脑数据集的任意位置均能保持一致。
6存储性能
①可配置raid5或raid6;
②在配置为raid5时,可用存储容量≥70TB,并具有在未来扩展到160T的能力;
③顺序读速度≥1.5Gbps,顺序写速度≥0.8Gbps。
7控制主机最低配置
一线品牌工作站: CPU:金牌5122 3.8GHz或同级别;内存:DDR4 128G;显卡:NVIDIA T1000 4GB显卡或同级别;
①系统盘:256G SATA固态硬盘
②数据硬盘:1个8TB企业级
③操作系统:正版Windows 10专业版64位;
④输入输出设备:22英寸液晶显示器、无线键鼠;
8软件功能
①自动探测样品轮廓(实时获取有效数据范围,避免无效数据的采集);
②采集图像live显示(实时显示正在获取的图像);
③采集图像recall显示(可方便查看、浏览已采集的数据,提供可快速定位数据区域的导航功能);
④实时生成三维投影图(通过降维处理,便于快速预览部分实验结果);
⑤数据实时打包以及传输(可在数据采集的过程中,将数据实时传输到远程存储服务器,避免100MB以下小文件的低效率传输);
⑥硬件的软件控制(通过软件,实现对光源、运动控制、探测器等大部分设备的参数调节、开关机控制);
⑦联网远程监控接口(可将仪器运行状况传递给远程的中控台);
⑧异常自动报警(采集发生异常时,可通过以太网、电信网通知管理员);
⑨断点自动恢复(可中断数据采集,并在合适的时间进行自动恢复);
⑩日志功能(记录操作、异常等);
⑪远程海量存储支持(可通过samba等方式远程连接PB级海量存储,需提供可行的解决方案)。
9图像处理工作站
CPU:至强金5122,3.8GHz或同级别;内存:256GB 2400MHz DDR4;显卡:NVIDIA RTX A2000 12GB显卡或同级别或同级别;说明:高性能工作站可实现TB级图像数据的加载、分析处理及三维可视化。
系统盘:256GB SATA固态盘
数据盘:1T企业级×8
显示器:U2518DR或同级别
操作系统:Win10专业版64位
10图像处理软件功能
包含原始2D图像拼接、去躁、均一化等功能;
包含三维数据处理和分析相关软件等
上述参数可满足常规模式动物小鼠、大鼠等大组织器官高精度三维成像,最大成像尺寸5cm×5cm×2.5cm,40倍物镜下成像分辨率为0.35×0.35×1μm可成像出神经纤维结构的完整形态,可满足对中枢及外周大组织精细结构的三维成像。
主要功能及特色
BioMapping5500荧光显微光学切片断层成像系统,能全自动化地高分辨率获取全脑神经结构、全器官/组织血管网络等三维数据集
样本检测注意事项
"1.生物组织样本为实现高质量高精度三维成像效果需进行充分灌流,尽量去除血液残留,减少血红蛋白背景和自发荧光。无法灌流样本可采用肝素钠+吐温-20+PBS混合溶液多次漂洗去除血液杂质残留。
2.激光器为473nm和561nm适用于普遍的GFP,YFP,FITC,Tdtomato,mCherry,mScarlet等红绿荧光蛋白或红绿荧光染料。其他荧光蛋白/分子请查阅相关荧光波谱;
3.进行fMOST成像前需通过切片荧光成像预实验验证标记方案,预估荧光强度和激光功率设定,信号过强时成像过曝后数据无法修复,信号过弱同样不适用,信背比需至少大于1.5。
4.成像前对样本硬度评估,样本内有气泡、偏软、爆聚等情况不宜上机,易损伤刀具。(硬度判断:用手捏树脂变形即硬度不足,或邵氏硬度计测均值50~80HA)
5.胞体统计分析:信号不可太弱,胞体信号灰度:背景灰度需>1.5方可通过软件进行胞体检测服务;
6.神经纤维分析:病毒标记纤维密度不可过高,稀疏标记方能进行单神经元追踪,否则数据太密集,处理难度倍增。提前通过梯度病毒标记切片测试后方可进行成像。"
2.激光器为473nm和561nm适用于普遍的GFP,YFP,FITC,Tdtomato,mCherry,mScarlet等红绿荧光蛋白或红绿荧光染料。其他荧光蛋白/分子请查阅相关荧光波谱;
3.进行fMOST成像前需通过切片荧光成像预实验验证标记方案,预估荧光强度和激光功率设定,信号过强时成像过曝后数据无法修复,信号过弱同样不适用,信背比需至少大于1.5。
4.成像前对样本硬度评估,样本内有气泡、偏软、爆聚等情况不宜上机,易损伤刀具。(硬度判断:用手捏树脂变形即硬度不足,或邵氏硬度计测均值50~80HA)
5.胞体统计分析:信号不可太弱,胞体信号灰度:背景灰度需>1.5方可通过软件进行胞体检测服务;
6.神经纤维分析:病毒标记纤维密度不可过高,稀疏标记方能进行单神经元追踪,否则数据太密集,处理难度倍增。提前通过梯度病毒标记切片测试后方可进行成像。"
设备使用相关说明
fMOST 收费标准:采集精度:0.35微米 x 0.35 微米 x 1微米 30000元;采集精度:0.35微米 x 0.35 微米 x 2微米 20000元;荧光数据基础级分析处理:5000元 其他请联系管理员咨询。
预约资源
检测项目
附件下载
公告
同类仪器